[Loris-dev] IMAGE UPLOAD FAILURE

[Olano.María]

Hello!

We have followed the imaging upload process throught the imaging_non_minc_insertion.pl script and unfortunately we are unable to see the image associated to the patient. This is what we typed into the cmd and the response.

uploadNeuroDB/imaging_non_minc_insertion.pl -profile prod -upload_id 1 -file_path /data/casadp/data/157011001_223572_PathologicalPancreas.zip -output_type native -scan_type he -date_acquired 2012-04-20 -scanner_id 1 -coordin_space native -reckless -verbose -patient_name 157011001_223572_PathologicalPancreas

log dir is /data/casadp/data/logs and log file is /data/casadp/data/logs/FileLoad-9-55-_KU5t4.log.
PSCID is: 157011001
CandID id: 223572
visit_label is: PathologicalPancreas
PSCID is: 157011001
CandID id: 223572
visit_label is: PathologicalPancreas
    -> ScannerID was set to 1

    -> SessionID was set to 2

    -> Acquisition date was set to 2012-04-20

    -> Output type was set to native
Acquisition date: 2012-04-20

When seeing the log dir this is what greets us
==> computing md5 hash for MINC body.

--> md5: ac8645a1c1a1619d712e0703cdde22cd

File /data/casadp/data/157011001_223572_PathologicalPancreas.zip
moved to:
/data/casadp/data/assembly/223572/PathologicalPancreas/mri/native/casadp_223572_PathologicalPancreas_he_001.zip

And the image is indeed in that path. However, when we return to our frontend, it says there is no imaging data available. Is there a step we haven't followed?

If you have any suggestions as to what to do, we'd be more than happy to hear it.

Thank you in advance!

María





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