[MINC-users] minc tool to extract voxel values within a mask?

[Jérôme Redouté]

Le 02/02/2017 à 01:10, Gabriel A. Devenyi a écrit :
> The closest thing I can find is mincextract but it doesn't have mask
> support.

you can use

mincstats -mean -mask LABELED_IMAG.mnc -mask_binvalue LABEL IMAGE.mnc

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Jérôme Redouté
Ph.D. - Ingénieur de Recherche - Université Claude Bernard - Lyon1
CERMEP - Imagerie du vivant
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