<div dir="ltr"><div><div>Hi all,<br><br></div><div>Our team is working on getting Loris MRI up and running. We have the web-server and database server up and running with no issues. We've also gone through the install instructions for Loris MRI. We're stuck on uploading an MRI through the GUI image uploader. <br></div><div><br><b>Versions: </b>loris v24.1.4 & loris-mri v24.1.11.<br><b>DICOMs:</b> (From NIH's visible human project)<br>See: <a href="https://www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html" target="_blank">https://www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html</a><br><a href="https://data.lhncbc.nlm.nih.gov/public/Visible-Human/Additional-Head-Images/MR_CT_DICOM/MRI/T1/index.html" target="_blank">https://data.lhncbc.nlm.nih.gov/public/Visible-Human/Additional-Head-Images/MR_CT_DICOM/MRI/T1/index.html</a><br></div><div><b>File name:</b> MTL0000_951855_V1.zip</div><div><br></div><div>First we create a new candidate: <b>DCCID: 951855 PSCID: MTL0000</b></div><div>Then we create a new visit for that candidate and set the visit label to V1.</div><div>Finally, we try to upload <b>MTL0000_951855_V1.zip </b>through the imaging uploader GUI.</div><div><br></div></div><b>The Error:<br><br></b><img src="cid:ii_ljp25bpu0" alt="image.png" class="gmail-CToWUd gmail-a6T" tabindex="0" width="578" height="425"><div><br><br><b>Details:</b><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><i>Processing details for upload 1 of MTL0000 (CandID 951855) at V1:</i><br><br><i>The candidate info validation has passed.</i><br><br><i>The dicomTar.pl execution has successfully completed</i><br><br><i>==> verifying dicom archive md5sum (checksum)</i><br><br><i>-> checksum for target        :  10ee0f329d92e5989984e3a74cb9d5b3</i><br><i>-> checksum from database :  10ee0f329d92e5989984e3a74cb9d5b3</i><br><br><i>==> Verifying acquisition center</i><br><i>-> Center Name : UNKN</i><br><i>-> CenterID  : 0</i><br><br><br><i>==> Trying to determine scanner ID</i><br><br><i> ERROR:
 The validation has failed. Either re-run the validation again and fix 
the problem. Or re-run tarchiveLoader.pl using -force to force the 
execution.</i><br><br><br><i>The tarchiveLoader.pl insertion script has failed.</i><br><i>Upload processing is finished and failed</i><br></blockquote><br></div><div><br>Further,
 I'm curious about *how* tightly-coupled the DICOM data is to 
loris-isms. It seems the perl code responsible for processing the 
DICOM pulls various pieces of data out of the DICOM and inserts those 
values into the database. Do *all* MRI's associated with a candidate need 
to have their DICOM metadata coded to that candidate, or should the file
 name providing the PSC/CAND ID's be enough?</div><div><br></div><div>Hoping someone can help us get the MRI pipeline running end to end :)<br></div><div><br></div><div>Thanks,<br></div><div>John<i><br></i></div></div>