[Loris-dev] RAM/ Memory requirements

Sat Nov 27 21:25:30 EST 2021

Hi Olga,

We are happy to help. Perhaps, your group could register on the loris-dev mailing list, and you could pose your question(s) there. You'll have access to the full array of developers. Then, if that isn't fruitful, we can book a time to go through this on a Zoom call? We deal with a great deal of support requests and this is the most effective way to triage them. Sometimes, the issue is quite simple to solve.

Best,

Samir Das

________________________________
From: Rico_Díez.Olga <oricod at ext.cnio.es>
Sent: Monday, November 22, 2021 5:02 AM
To: Samir Das <samir.das at mcgill.ca>; Christine Rogers <rogers at bic.mni.mcgill.ca>
Cc: loris.info at mcin.ca <loris.info at mcin.ca>
Subject: RE: RAM/ Memory requirements

Hi Samir and thanks for your clarifying response,

These are really good news for my team.

I was wondering if you or a member of your team will have some time to help us with the installation, since we have been dealing with it some weeks and don’t know what is wrong.

Maybe we could connect via zoom or something and resolve this matter in a moment with your help, better than trying it by our own and spending more weeks dealing with it.

Could we make this?

Thanks in advance,

Olga

De: Samir Das <samir.das at mcgill.ca>
Enviado el: sábado, 20 de noviembre de 2021 17:48
Para: Rico_Díez.Olga <oricod at ext.cnio.es>; Christine Rogers <rogers at bic.mni.mcgill.ca>
CC: loris.info at mcin.ca
Asunto: Re: RAM/ Memory requirements

CAUTION: This email originated from outside of the organization. Do not click links or open attachments unless you recognize the sender and know the content is safe

Hi Olga,

Apologies for the delayed response. This email got missed somehow. Importing data formats other than DICOMS is routinely done. We typically import them using our Derived Data script (even though this is raw data). Any visualization of the files might not work with our native viewer (BrainBrowser), but other viewers can be plugged into the LORIS environment (since LORIS is open source). Let me know if you have any further questions.

Best,

Samir Das

________________________________

From: Rico_Díez.Olga <oricod at ext.cnio.es>
Sent: Wednesday, October 27, 2021 11:19 AM
To: Christine Rogers <rogers at bic.mni.mcgill.ca>
Cc: loris.info at mcin.ca <loris.info at mcin.ca>
Subject: RE: RAM/ Memory requirements

Hello Christine,

The Project would be managing data from clinical data, and forms, to medical (TC, MRI) and pathological imaging and also genomic data.

So we will try to use it as a connection between all these heterogenious data.

So I have got another question, for pathological data, the images are very heavy and also are in different format from DICOM ( .czi format), is there any posibility to custmize the data base in Loris to be able to import these format images?

Thanks for all the info, its been very useful.

Olga Rico.

De: Christine Rogers <rogers at bic.mni.mcgill.ca>
Enviado el: martes, 26 de octubre de 2021 0:38
Para: Rico_Díez.Olga <oricod at ext.cnio.es>
CC: loris.info at mcin.ca
Asunto: Re: RAM/ Memory requirements

CAUTION: This email originated from outside of the organization. Do not click links or open attachments unless you recognize the sender and know the content is safe

Hello,

Thank you for your inquiry --

For the RAM requirements, this often depends on the size of files in your dataset.  For storage space on server/disk, this is estimated around 3x your dataset size, depending on the types of data you have.

LORIS is installed on a Unix system, and additional context for requirements is available in our LORIS Governance document, attached.

Could you let us know a few details about your project, so that I can give you better information for your research context?  It would be good to know what types of data you are collecting (mri scans, biosamples, etc) and the kind of research project.

Thank you, and please don't hesitate with further questions.

Christine

On Wed, Oct 13, 2021 at 10:29 AM Rico_Díez.Olga <oricod at ext.cnio.es<mailto:oricod at ext.cnio.es>> wrote:

Good mooring team,

I would like to ask you a short doubth about LORIS, ¿what are the memory or RAM requirements for the use and installation of LORIS?

Thanks in advance,

Olga Rico.

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--

Research Project Officer
christine.rogers at mcgill.ca<mailto:christine.rogers at mcgill.ca>
McGill Centre for Integrative Neuroscience | MCIN.ca

Montreal Neurological Institute-Hospital

McGill University | Montreal | Canada

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